标志以“医学物理与技术中心”、“合肥” 英文字母缩写“CMPT”"H"和医疗十字标志及原子、电子造型为设计元素，经艺术组合变形构成，形象的体现出医学物理与技术中心医工结合和转化医学的内涵特征，也展现了合肥物质科学研究院医学物理与技术中心与时俱进、蓬勃发展的美好未来，为人民的健康保驾护航，整体造型简洁明快，识别性强，达到内容与形式的融合统一。
方案三：设计者：陈云 地址：江苏省常州市
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标识主要以创新发展、科技腾飞为主题思想设计，字母“HF”（合肥）融合“CMPT”（医学物理与技术中心的缩写）为主体设计核心，并有机地融入了汉字“中”（中科院、中心）、腾飞的吉祥鸟、环形科技运动轨迹、绽放的广玉兰花等元素，高度概括出“中心”的形象特征与内涵。
汉字“中”与环形科技轨迹的有机融合，体现出“中心”秉承现代、科学的发展理念，将高端物理技术向医学应用转化研究的特征，不断持续发展的形象内涵。
腾飞的吉祥鸟，代表着吉祥与美好的祝福，展现出“中心”不断创新、追求卓越的科学精神，并昭示着“中心”呈现出无限腾飞发展的良好态势。
吉祥鸟有机地变化为绽放的广玉兰花，在表明合肥地域文化特征的同时，传达出“中心”健康、和谐发展的内涵。
标识整体呈圆形的外观，体现出一种团结、同心同德与高度的凝聚力，同时圆也赋予了着圆满、美好、融通，彰显国际化的特质。
蓝色为天空与大海的颜色，彰显出博大、包容的品牌内涵，同时蓝色也赋予了科技、稳健与高效的内涵；红黄两色寓意着激情、活力、创新与辉煌；标识整体主题突出、创意独特，极具视觉冲击力与艺术感染力，适合多种途径传播与使用。
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